Newell’s regresará al certamen de futsal que organiza la AFA, tras haber sido aceptado el pedido de los Leprosos a la casa madre del fútbol argentino, para volver a participar del torneo tras casi dos décadas.

En definitiva, el Rojinegro será el único equipo del interior en participar de estos torneos. Además de ser miembro fundador de los torneos de AFA, fue subcampeón del primer certamen oficial (1986) y campeón en el siguiente (1987).

En 1989 aportó numerosos jugadores a la Selección Argentina (entre ellos el actual entrenador Gabriel Valarín), además del DT para el primer Mundial FIFA de futsal (Países Bajos 1989).

Newell’s competiría ininterrumpidamente en AFA hasta el año 2000 alcanzando dos nuevos títulos en ese lapso: el torneo de 1994 y la copa de primera división del mismo año, con un recordado equipo que contaba con jugadores brasileros. En el año 2000 se desafilia durante la presidencia de Eduardo López y se disuelve la disciplina.